经过前面的全基因组特征调查(survey)后,我们发现这是一个复杂基因组,杂合度较高,可以以二代+三代测序技术相结合的策略进行全基因组组装,还可以以Hi-C(高通量染色体捕获技术,High-through chromosome conformation capture)技术进行辅助组装。这里我用华大开发的二代测序组装工具SOAPdenovo,用二代测序数据对进行初步基因组组装。
经过前面的全基因组特征调查(survey)后,我们发现这是一个复杂基因组,杂合度较高,可以以二代+三代测序技术相结合的策略进行全基因组组装,还可以以Hi-C(高通量染色体捕获技术,High-through chromosome conformation capture)技术进行辅助组装。这里我用华大开发的二代测序组装工具SOAPdenovo,用二代测序数据对进行初步基因组组装。