前面说了如何用eggNOG-mapper快速注释功能基因,我们最后得到了很多结果文件,其中最重要的是两个annotations
文件。这里主要讲一下怎么整理结果文件,并且对注释的结果做质量评估。
前面说了如何用eggNOG-mapper快速注释功能基因,我们最后得到了很多结果文件,其中最重要的是两个annotations
文件。这里主要讲一下怎么整理结果文件,并且对注释的结果做质量评估。
通过前面的纠错和校正步骤,我们得到了组装完成的基因组序列,接下来就是进行基因组的组装质量评估。质量评估的软件和方法比较多,这里分两篇博客记录,本篇主要演示如何用BUSCO和LAI指数评价基因组组装质量。