最近用自己组装的植物基因组在做基因家族分析,简单记录下自己对数据的处理以及分析的流程。
随着现在测序技术的普及,越来越多的植物做了全基因组测序,对于基因组比较小的植物,现在纯做基因组组装和注释已经很难发文章了,一般来说我们还要再提出和解决一些生物学问题,最基础的就是通过比较基因组学,对系统发育中的代表性物种之间的基因家族进行比较分析、构建系统发育图谱,来揭示这些基因家族的起源和功能。
最近用自己组装的植物基因组在做基因家族分析,简单记录下自己对数据的处理以及分析的流程。
随着现在测序技术的普及,越来越多的植物做了全基因组测序,对于基因组比较小的植物,现在纯做基因组组装和注释已经很难发文章了,一般来说我们还要再提出和解决一些生物学问题,最基础的就是通过比较基因组学,对系统发育中的代表性物种之间的基因家族进行比较分析、构建系统发育图谱,来揭示这些基因家族的起源和功能。